Después de aplicar esta configuración en Compiz nuestro menu y panel (aunque no se nota en la captura)pasará de verse así
A verse así
Lo que debemos hacer es abrir el Administrador de Opciones Compiz Config ( ya vimos como instalarlo aquí) que se encuentra en Sistema->Preferencias y buscamos la opción Opacity Brigthness and Saturation
una vez dentro veremos algo como la captura que sigue, dentro el apartado windows especific settings ingresamos una nueva línea (haciendo click en nuevo) y se abrirá una ventana en la que ingresaremos lo siguiente.
(name=gnome-panel) | (type=Menu | PopupMenu | DropdownMenu | Dialog | ModalDialog)
En windows value le damos el valor de transparencia que mas nos guste 85 es en mi caso.
Otro tip, si quieres que las ventanas sean transparentes cuando las mueves busca el ícono Mover Ventana
y lleva el apartado opacidad al nivel de transparencia que sea de tu gusto.
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