Järgmises artiklis heidame pilgu Avogadrole. See on tasuta avatud lähtekoodiga molekulaarse redigeerimise rakendus Gnu / Linuxi, Windowsi ja MacOS-i jaoks. See on programm, mida saab kasutada arvutuskeemia, molekulaarne modelleerimine, bioinformaatika, materjaliteadus ja paljud muud valdkonnad.
Rakendust kasutatakse aastal VTK analüüsi ja visualiseerimise võimaluste jaoks. Samuti toetab see punktiandmete mahu esitamist või vektorväljade voogjooni. See pakub paindlikku, kvaliteetset renderdamist ja võimsat pistikprogrammi arhitektuuri. Umbes lihtne ja hõlpsasti kasutatav tarkvara, mis on üliõpilaste ja teadlaste jaoks valmis kasutamiseks. Avogadro on tasuta tarkvara, mida saate uuesti levitada ja / või muuta vastavalt Free Software Foundationi avaldatud GNU General Public License'i litsentsi versioonile 2 või hilisemale versioonile.
Erinevalt teistest veebipõhistest 2D / 3D molekulivaaturitest on Avogadro kasutab otse OpenGL-i ja pakub natiivseid töölaua pakette. See rakendus kasutab standardite komplekti, mis võimaldab arvutiprogrammidel kasutada 2D / 3D riistvara renderdamise funktsioone (GPU). Avogadro toetab kastivälist mitmekeermelist arvutamist ja töötlemist, tal on interaktiivseid tööriistu, käske ja kohandatud Pythoni skripte.
Avogadro üldised omadused
- See on mitmeplatvormiline programm, nii et saame seda kasutada Gnu / Linuxis, Windowsis ja Mac OSX-is.
- See on kerge programm pakkudes kõrget jõudlust.
- Vaatamata kõigele, mida see pakub, on tal mõned minimaalsed riistvaranõuded.
- Programm on tõlgitud erinevatesse keeltesse, nagu nad on; Hiina, prantsuse, saksa, itaalia, vene, hispaania ja mõned teised.
- Selle liides on selge ja lihtne kasutada.
- Sisaldab suurt komplekti tööriistad mõõtmiseks, joondamiseks, visualiseerimiseks, manipuleerimiseks ja joonistamiseks.
- See pakub ka meile laiendused koos laiendushalduriga.
- Lubab meile import erinevatest rakendustest.
- Toetab paljusid avatud vorminguid.
- Saame hakkama vaadake perioodilisustabelit.
- Saame hakkama ehitada 2D ja 3D molekulimudeleid.
- Võimaldab sisestada, koostada ja muuta eelnevalt kujundatud mooduleid (DNA, RNA, fragment, SMILES, peptiid, polümeer).
- Elektrostaatiliste potentsiaalide kaartide visualiseerimine.
- Kasutamine molekulide aatomite analüüs (Bader): QTAIM ja WFN.
- Molekuli ja pinna vastasmõjud.
- Saame hakkama tööriistadega manipuleerida, mõõta ja joondada. Samuti võime loota tööriistade valimine, automaatne pööramine ja automaatne optimeerimine.
- Meeskond Avogadro pakub kõigile kasutajatele komplekti õpetused arendajatele abiks, allikast koostamiseks ja laienduste panustamiseks Nad avaldavad ka selge API dokumentatsiooni.
Installige Avogadro Ubuntu
Avogadro on saadaval kui flatpak pakk Ubuntu süsteemi jaoks. Enne selle programmi installimist peab see süsteem olema meie süsteemis lubatud. Kui teil seda veel pole ja kasutate Ubuntu 20.04, saate jätkata Giid et mõni kolleeg kirjutas mõni aeg tagasi siia blogisse.
Kui see tehnoloogia on teie süsteemis juba lubatud, saate installimist jätkata. Peate lihtsalt avama terminali (Ctrl + Alt + T) ja käivitama selles järgmise käsu installige Avogadro:
flatpak install flathub org.openchemistry.Avogadro2
Pärast installimist saate käivitage programm otsib meie meeskonnas kannu. Avogadro molekuliredaktori saate avada ka terminalis järgmise käsu abil:
flatpak run org.openchemistry.Avogadro2
Desinstallige
et eemaldage see programm, peame avama ainult terminali (Ctrl + Alt + T) ja käivitama selles käsu:
flatpak uninstall org.openchemistry.Avogadro2
Avogadro on arenenud molekulivaataja ja -toimetaja, mis on mõeldud platvormidevaheliseks kasutamiseks sellistes valdkondades nagu arvutuskeemia, molekulaarne modelleerimine, bioinformaatika, materjaliteadus ja sellega seotud valdkonnad. Mis veel pakub võimsa pistikprogrammi arhitektuuriga paindlikku kvaliteedi renderdamist.
See tarkvara on avatud lähtekoodiga projekt, mille eesmärk on seda, et kõik arendajad, teadlased ja üliõpilased, kes seda soovivad, saaksid seda kasutada ilma piiranguteta kogu maailmas. See võib saate selle programmi kohta lisateavet aadressil projekti veebisait või teie leht GitHubis.