Avogadro, szerkessze és jelenítse meg a molekulákat ezzel a nyílt forráskódú programmal

az avogadróról

A következő cikkben megnézzük Avogadrót. Ez egy ingyenes, nyílt forráskódú, molekuláris szerkesztő alkalmazás a Gnu / Linux, a Windows és a MacOS számára. Ez egy olyan program, amely használható számítási kémia, molekuláris modellezés, bioinformatika, anyagtudomány és még sok más terület.

Az alkalmazást a VTK elemzési és megjelenítési képességek. Támogatja a kötet ábrázolását a pontadatokhoz vagy az áramvonalakat a vektor mezőkhöz. Rugalmas, kiváló minőségű megjelenítést és erőteljes plug-in architektúrát kínál. Kb egy egyszerű és könnyen használható szoftver, amely a hallgatók és a kutatók számára is használható. Az Avogadro egy ingyenes szoftver, amelyet terjeszthet és / vagy módosíthat a Free Software Foundation által közzétett GNU General Public License, a licenc 2. verziójának vagy bármely újabb verziójának feltételei szerint.

Más webalapú 2D / 3D molekuláris nézőktől eltérően Az Avogadro közvetlenül az OpenGL-t használja és natív asztali csomagokat kínál. Ez az alkalmazás olyan szabványokat használ, amelyek lehetővé teszik a számítógépes programok számára a 2D / 3D hardveres megjelenítési funkciók használatátGPU). Az Avogadro támogatja a dobozon kívüli, többszálas számítást és feldolgozást, rendelkezik interaktív eszközökkel, parancsokkal és egyedi Python-szkriptekkel.

Avogadro általános jellemzői

kénsavmolekula

  • Ez egy többplatformos program, így használhatjuk Gnu / Linux, Windows és Mac OSX rendszerekben.
  • van könnyű program nagy teljesítményt nyújt.
  • Annak ellenére, hogy mindent kínál, van néhány minimális hardverkövetelmények.
  • A program az különféle nyelvekre lefordítva, mint ők; Kínai, francia, német, olasz, orosz, spanyol és még néhányan.
  • A kezelőfelülete egyértelmű és könnyen használható.
  • Nagy készletet tartalmaz mérési, igazítási, megjelenítési, manipulációs és rajzeszközök.
  • Ez felajánlja nekünk is a kiterjesztések kezelőjével együtt.
  • Megengedi nekünk import különféle alkalmazásokból.
  • Sok nyitott formátumot támogat.

periódusos táblázat

  • Képesek leszünk nézze meg a periódusos táblázatot.
  • Tudunk építsen 2D és 3D molekulamodelleket.
  • Lehetővé teszi előre tervezett modulok beszúrását, felépítését és módosítását (DNS, RNS, töredék, Mosolyok, peptid, polimer).
  • Az elektrosztatikus potenciáltérképek megjelenítése.
  • A molekulák atomjainak elemzése (Rosszabb): QTAIM és WFN.
  • Molekula-felület kölcsönhatások.

alkotó molekulák

  • Tudunk manipulálni, mérni és igazítani az eszközöket. Számíthatunk rá is eszközök kiválasztása, automatikus elforgatása és automatikus optimalizálása.
  • A csapat Az Avogadro minden felhasználónak egy sor készletet kínál oktatóanyagok így a fejlesztők segíthetnek, forrásból összeállíthatják és hozzájárulhatnak a bővítményekhez. Egyértelmű API dokumentációt is közzétesznek.

Telepítse az Avogadro-t az Ubuntura

Avogadro az elérhető a flatpak csomag az Ubuntu rendszerhez. A program telepítése előtt engedélyeznünk kell ezt a technológiát a rendszerünkben. Ha még mindig nincs, és az Ubuntu 20.04-et használja, folytathatja Az útmutató hogy egy kolléga írt erre a blogra egy ideje.

Ha már engedélyezte ezt a technológiát a rendszerén, folytathatja a telepítést. Csak meg kell nyitnia egy terminált (Ctrl + Alt + T), és futtatnia kell benne a következő parancsot telepítse az Avogadrót:

telepíteni avogadro

flatpak install flathub org.openchemistry.Avogadro2

A telepítés után megteheti futtassa a programot a korsót keresi csapatunkból. Megnyithatja az Avogadro molekulaszerkesztőt a terminál következő parancsával:

avogadro kancsó

flatpak run org.openchemistry.Avogadro2

eltávolítást

hogy távolítsa el ezt a programot, csak meg kell nyitnunk egy terminált (Ctrl + Alt + T), és végre kell hajtanunk benne a parancsot:

uninstall avogadro

flatpak uninstall org.openchemistry.Avogadro2

Az Avogadro egy fejlett molekulanéző és -szerkesztő, amelyet platformokon keresztüli felhasználásra terveztek olyan területeken, mint a számítási kémia, a molekuláris modellezés, a bioinformatika, az anyagtudomány és a kapcsolódó területek. Mi több rugalmas minőségi megjelenítést kínál hatékony plugin architektúrával.

Ez a szoftver egy nyílt forráskódú projekt, amelynek célja, hogy minden fejlesztő, kutató és hallgató korlátozás nélkül használhassa, aki akar. Az tud további információ erről a programról: projekt honlapja vagy a te oldal a GitHubon.


A cikk tartalma betartja a szerkesztői etika. A hiba bejelentéséhez kattintson a gombra itt.

Legyen Ön az első hozzászóló

Hagyja megjegyzését

E-mail címed nem kerül nyilvánosságra. Kötelező mezők vannak jelölve *

*

*

  1. Az adatokért felelős: Miguel Ángel Gatón
  2. Az adatok célja: A SPAM ellenőrzése, a megjegyzések kezelése.
  3. Legitimáció: Az Ön beleegyezése
  4. Az adatok közlése: Az adatokat csak jogi kötelezettség alapján továbbítjuk harmadik felekkel.
  5. Adattárolás: Az Occentus Networks (EU) által üzemeltetett adatbázis
  6. Jogok: Bármikor korlátozhatja, helyreállíthatja és törölheti adatait.