В следующей статье мы рассмотрим iRASPA. Это бесплатный молекулярный редактор и программа просмотра для Gnu / Linux, MacOS и Windows, выпущенных под лицензией MIT. Поддерживает металлы, оксиды металлов, керамику, биоматериалы, цеолиты, глины, металлоорганические структуры и многое другое. Содержит более 8000 структур из базы данных CoRE Metal-Organic Frameworks. Если вы работаете в химии или других областях, связанных с молекулами, эта программа может быть вам полезна. В следующих строках мы увидим, как мы можем установить молекулярную программу просмотра iRASPA в Ubuntu через Snap.
Это пакет визуализации с возможностями редактирования, предназначенный для материаловедения. Кроме того, с помощью этой программы мы сможем обрабатывать большие структуры (сотни тысяч атомов), включая загорание окружающей среды, с высокой частотой кадров. Это программное обеспечение воспользоваться новейшими технологиями отображения с хорошей производительностью.
С iRASPA мы можем создавать и редактировать структуры, изображения и фильмы. Он также имеет окклюзию окружающей среды, рендеринг с расширенным динамическим диапазоном, поверхности адсорбции, текстовые аннотации, реплики ячеек и суперячейки. Поддерживает цилиндры, сферы и многоугольные призмы, а также операции симметрии. Поддерживаемые форматы ввода: CIF, mmCIF, PDB, XYZ и VASP POSCAR / CONTCAR / XDATCAR. Поддерживаемые форматы вывода: CIF-, 8/16 бит, RGB / CMYK, TIFF без потерь для изображений и mp4 (h264) для видео.
Эта программа была созданный Дэвидом Дуббельдамом (Амстердамский университет, Нидерланды), София Калеро (Университет Пабло де Олавиде, Севилья, Испания) и Тийс Влугт (Делфтский технологический университет, Нидерланды). Они также рассчитывают на вклад Рэндалла К. Снурра (Северо-Западный университет, Эванстон, США.) и Чунг Г. Йонгчул (Школа химической и биомолекулярной инженерии, Пусан, Южная Корея). Приложение написано на Swift 4.
Общие характеристики IRASPA
Некоторые из основных функций iRASPA:
- Через iCloud, iRASPA имеет доступ к базе данных CoRE Metal-Organic Frameworks, содержащей 4764 структуры и 2932 структуры, усиленные атомными зарядами..
- Все структуры можно фильтровать (в реальном времени) с использованием пользовательских параметров.
- La Главное окно - это ваш главный интерфейс для просмотра, редактирования и управления всеми частями проектов. Он использует интерфейс основных сведений, в котором изменения в главном контроллере представления (главный вид проекта) изменение других взглядов.
- Создавать и редактировать структуры.
- Мы можем создать изображения высокого качества.
- Окклюзия окружающей среды и рендеринг с высоким динамическим диапазоном.
- Мы сможем создать коллаж структур.
- Программа позволит нам текстовая аннотация.
- Реплики клеток и суперклетки.
- Операции симметрии как пространственная группа и обнаружение примитивных клеток.
- Расчет паросодержания и площади поверхности на GPU в секундах
Это лишь некоторые из возможностей iRASPA. Они могут подробно проконсультируйтесь со всеми из них в Веб-вики проекта.
Установите iRASPA на Ubuntu
Чтобы установить молекулярную программу просмотра iRASPA через Snap в нашей системе Ubuntu, у нас должна быть установлена поддержка этой технологии. Если в вашей системе нет этой технологии, вы можете следуйте инструкциям, предлагаемым в снэпкрафт продолжить установку.
Как только мы сможем установить в систему приложения Snap, мы сможем установить iRASPA Molecular Visualizer / Editor через диспетчер пакетов snap. Для этого нам нужно будет только открыть терминал (Ctrl + Alt + T) и выполнить следующую команду:
sudo snap install iraspa
Если в любое время вам понадобится обновить программу, это можно сделать, запустив в терминале:
sudo snap refresh iraspa
Мы можем запустить программу из меню Applications / Board / Activities или из любого другого средства запуска приложений, установленного на нашем компьютере. Мы также можем запустите iRASPA Molecular Visualizer / Editor в Ubuntu, используя эту команду в терминале (Ctrl + Alt + T):
iraspa
деинсталляция
к удалите программу просмотра молекул iRASPA через Снэп, нам нужно будет только открыть терминал (Ctrl + Alt + T), а затем выполнить следующую команду:
sudo snap remove iraspa
Пользователи смогут получить дополнительную информацию об этой программе из сайт проекта.