iRASPA分子可视化器/编辑器,分子编辑器和可视化器

关于iRASPA

在下一篇文章中,我们将介绍iRASPA。 这是 免费的分子编辑器和查看器 适用于以MIT许可发布的Gnu / Linux,MacOS和Windows。 支持金属,金属氧化物,陶瓷,生物材料,沸石,粘土,金属有机结构等。 包含来自CoRE金属有机框架数据库的8000多种结构。 如果您从事化学或其他涉及分子的领域的工作,该程序可能对您有用。 在下面的几行中,我们将看到如何通过Snap在Ubuntu中安装iRASPA分子查看器。

它是一种可视化软件包,具有针对材料科学的编辑功能。 此外,借助该程序,我们将能够以高帧频处理大型结构(数十万个原子),包括环境光遮挡。 这个软件 利用最新的显示技术 表现不错。

使用iRASPA 我们可以创建和编辑结构,图像和电影。 它还具有环境光遮挡,高动态范围渲染,吸附表面,文本注释,单元格副本和超级单元格。 支持圆柱体,球体和多边形棱柱以及对称操作。 支持的输入格式为; CIF,mmCIF,PDB,XYZ和VASP POSCAR / CONTCAR / XDATCAR。 支持的输出格式为; CIF-,8/16位,RGB / CMYK,图像的无损TIFF和视频的mp4(h264).

元素iRASPA

这个程序已经 由David Dubbeldam(荷兰阿姆斯特丹大学),索非亚·卡莱罗(SofíaCalero)(西班牙塞维利亚Pablo de Olavide大学)和Thijs Vlugt(荷兰代尔夫特理工大学)。 他们还指望Randall Q. Snurr(西北大学,美国埃文斯顿。)和Chung G. Yongchul(韩国釜山化学与生物分子工程学院)。 该应用程序是用Swift 4编写的。

IRASPA的一般特征

iRASPA工作

iRASPA的一些主要功能包括:

  • 通过iCloud, iRASPA可以访问CoRE金属有机框架数据库,其中包含4764个结构和2932个原子电荷增强的结构.
  • 所有结构均可过滤 (实时)使用用户定义的参数。
  • La 主窗口是查看,编辑和管理项目所有部分的主要界面。 它使用一个主详细信息界面,在该界面中可以更改主视图控制器(项目主视图)更改其他视图。
  • 创建和编辑结构.
  • 我们可以创造 高质量图像.
  • 环境遮挡和 高动态范围渲染.
  • 我们将能够创建 结构拼贴.
  • 该计划将使我们 文字注解.
  • 细胞复制品和超级细胞.
  • 作为空间群的对称运算和 原始细胞检测.
  • GPU计算空隙率和表面积 在几秒钟内。

这些只是iRASPA的部分功能。 他们能 请在 项目网站Wiki.

在Ubuntu上安装iRASPA

要通过Snap在我们的Ubuntu系统上安装iRASPA分子查看器,我们必须支持此技术。 如果您的系统中没有这项技术,则可以 遵循提供的教程 快艇 进行安装.

一旦我们可以在系统上安装快照应用程序,我们就可以 通过快照包管理器安装iRASPA Molecular Visualizer / Editor。 为此,我们只需要打开一个终端(Ctrl + Alt + T)并执行以下命令:

卸载iRASPA

sudo snap install iraspa

如果您有任何需要 更新程序,可以通过在终端中运行来完成:

sudo snap refresh iraspa

我们可以从“应用程序/董事会/活动”菜单或计算机上安装的任何其他应用程序启动器启动程序。 我们也可以 在终端中使用以下命令在Ubuntu中启动iRASPA Molecular Visualizer / Editor(Ctrl + Alt + T):

iraspa

卸载

通过卸载iRASPA Molecular Viewer 捕捉,我们只需要打开一个终端(Ctrl + Alt + T),然后执行以下命令:

卸载iRASPA

sudo snap remove iraspa

用户将能够 从以下位置获得有关此程序的更多信息 项目网站.


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