I den næste artikel skal vi se på iRASPA. Dette er en gratis molekylær editor og seer til Gnu / Linux, MacOS og Windows, der frigives under MIT-licensen. Understøtter metaller, metaloxider, keramik, biomaterialer, zeolitter, ler, metallo-organiske strukturer og mere. Indeholder mere end 8000 strukturer fra CoRE Metal-Organic Frameworks-databasen. Hvis du arbejder inden for kemi eller andre områder, der beskæftiger sig med molekyler, kan dette program være nyttigt for dig. I de følgende linjer vil vi se, hvordan vi kan installere iRASPA molekylær viewer i Ubuntu via Snap.
Det er en visualiseringspakke med redigeringsfunktioner rettet mod materialevidenskab. Derudover vil vi med dette program være i stand til at håndtere store strukturer (hundreder af tusinder af atomer), herunder miljømæssig okklusion, med høje billedhastigheder. Denne software drage fordel af de nyeste skærmteknologier med god præstation.
Med iRASPA vi kan oprette og redigere strukturer, billeder og film. Det kommer også med omgivende okklusion, gengivelse af højt dynamisk område, adsorptionsoverflader, tekstkommentarer, cellereplikater og superceller. Understøtter cylindre, kugler og polygonale prismer og symmetrioperationer. De understøttede inputformater er: CIF, mmCIF, PDB, XYZ og VASP POSCAR / CONTCAR / XDATCAR. De understøttede outputformater er; CIF-, 8/16 bit, RGB / CMYK, tabsfri TIFF til billeder og mp4 (h264) til videoer.
Dette program har været skabt af David Dubbeldam (University of Amsterdam, Holland), Sofia Calero (Pablo de Olavide University, Sevilla, Spanien) og Thijs Vlugt (Delft University of Technology, Holland). De har også regnet med bidragene fra Randall Q. Snurr (Northwestern University, Evanston, USA.) og Chung G. Yongchul (School of Chemical and Biomolecular Engineering, Busan, Sydkorea). Ansøgningen er skrevet i Swift 4.
Generelle karakteristika ved IRASPA
Nogle af de vigtigste funktioner i iRASPA er:
- Gennem iCloud, iRASPA har adgang til CoRE Metal-Organic Frameworks-databasen indeholdende 4764 strukturer og 2932 strukturer forbedret med atomladninger.
- Alle strukturer kan filtreres (i realtid) ved hjælp af brugerdefinerede parametre.
- La hovedvindue er din hovedgrænseflade til at se, redigere og administrere alle dele af projekterne. Den bruger en masterdetaljer-grænseflade, hvor ændringer til hovedvisningscontrolleren (projektets mastervisning) ændring i andre synspunkter.
- Opret og rediger strukturer.
- Vi kan skabe billeder i høj kvalitet.
- Miljømæssig okklusion og gengivelse med højt dynamisk område.
- Vi vil være i stand til at skabe collage af strukturer.
- Programmet tillader os tekstkommentar.
- Celle replikaer og superceller.
- Symmetri fungerer som en rumgruppe og primitiv celledetektion.
- GPU-beregning af tomrumsfraktion og overfladeareal i løbet af få sekunder.
Dette er blot nogle af funktionerne i iRASPA. De kan konsulter dem alle detaljeret i Projektwebwiki.
Installer iRASPA på Ubuntu
For at installere iRASPA Molecular Viewer via Snap på vores Ubuntu-system skal vi have support til denne teknologi installeret. Hvis du ikke har denne teknologi i dit system, kan du følg den vejledning, der tilbydes i snapcraft for at fortsætte med installationen.
Når vi kan installere snap-applikationer på systemet, kan vi installer iRASPA Molecular Visualizer / Editor via snap-pakkehåndtering. For at gøre dette behøver vi kun at åbne en terminal (Ctrl + Alt + T) og udføre følgende kommando:
sudo snap install iraspa
Hvis du til enhver tid har brug for det opdater programmet, det kan gøres ved at køre i terminalen:
sudo snap refresh iraspa
Vi kan starte programmet fra menuen Applikationer / Board / Aktiviteter eller enhver anden applikationsstarter, der er installeret på vores computer. Det kan vi også start iRASPA Molecular Visualizer / Editor i Ubuntu ved hjælp af denne kommando i terminal (Ctrl + Alt + T):
iraspa
afinstallere
til afinstallere iRASPA Molecular Viewer via Snap, vi bliver kun nødt til at åbne en terminal (Ctrl + Alt + T) og derefter udføre følgende kommando:
sudo snap remove iraspa
Brugere kan få mere information om dette program fra projektwebsted.