U sljedećem ćemo članku pogledati iRASPA. Ovo je besplatni molekularni urednik i gledatelj za Gnu / Linux, MacOS i Windows koji je objavljen pod MIT licencom. Podržava metale, metalne okside, keramiku, biomaterijal, zeolite, gline, metalo-organske strukture i još mnogo toga. Sadrži više od 8000 struktura iz baze podataka CoRE Metal-Organic Frameworks. Ako radite u kemiji ili drugim područjima koja se bave molekulama, ovaj vam program može biti koristan. U sljedećim ćemo redovima vidjeti kako možemo instalirati iRASPA molekularni preglednik u Ubuntu putem Snapa.
To je paket za vizualizaciju, s mogućnostima uređivanja, namijenjen znanosti o materijalima. Uz to, s ovim programom moći ćemo se nositi s velikim strukturama (stotine tisuća atoma), uključujući okluziju iz okoliša, s visokim brzinama kadrova. Ovaj softver iskoristite najnovije tehnologije prikaza uz dobre performanse.
Uz iRASPA možemo stvarati i uređivati strukture, slike i filmove. Također dolazi s okluzijom okoline, prikazom dinamičkog raspona, adsorpcijskim površinama, oznakom teksta, replikama stanica i super stanicama. Podržava cilindre, kugle i poligonalne prizme i operacije simetrije. Podržani formati unosa su; CIF, mmCIF, PDB, XYZ i VASP POSCAR / CONTCAR / XDATCAR. Podržani izlazni formati su; CIF-, 8/16 bit, RGB / CMYK, TIFF bez gubitaka za slike i mp4 (h264) za videozapise.
Ovaj je program bio stvorio David Dubbeldam (Sveučilište u Amsterdamu, Nizozemska), Sofija Calero (Sveučilište Pablo de Olavide, Sevilla, Španjolska) i Thijs Vlugt (Tehničko sveučilište Delft, Nizozemska). Računali su i na doprinose Randalla Q. Snurra (Sveučilište Northwestern, Evanston, SAD.) i Chung G. Yongchul (Škola kemijskog i biomolekularnog inženjerstva, Busan, Južna Koreja). Prijava je napisana na jeziku Swift 4.
Opće karakteristike IRASPA-e
Neke od glavnih značajki iRASPA su:
- Kroz iCloud, iRASPA ima pristup bazi podataka CoRE Metal-Organic Frameworks koja sadrži 4764 strukture i 2932 strukture poboljšane atomskim nabojima.
- Sve se strukture mogu filtrirati (u stvarnom vremenu) pomoću korisnički definiranih parametara.
- La glavni prozor je vaše glavno sučelje za pregled, uređivanje i upravljanje svim dijelovima projekata. Koristi sučelje s glavnim detaljima, gdje se mijenjaju glavni kontroler prikaza (pogled glavnog projekta) promjena u drugim pogledima.
- Stvaranje i uređivanje struktura.
- Možemo stvarati slike visoke kvalitete.
- Okluzija okoliša i prikaz visokog dinamičkog raspona.
- Moći ćemo stvarati kolaž struktura.
- Program će nam omogućiti anotacija teksta.
- Replike stanica i super stanice.
- Operacije simetrije kao svemirska skupina i primitivno otkrivanje stanica.
- GPU proračun šupljine i frakcije površina u nekoliko sekundi.
Ovo su samo neke od značajki iRASPA-e. Oni mogu detaljno ih konzultirati u Projekt web wiki.
Instalirajte iRASPA na Ubuntu
Da bismo instalirali iRASPA molekularni preglednik putem Snap-a na naš Ubuntu sustav, moramo imati instaliranu podršku za ovu tehnologiju. Ako u svom sustavu nemate ovu tehnologiju, možete slijedite upute ponuđene u snapcraft za nastavak instalacije.
Jednom kad u sustav instaliramo ugrađene aplikacije, možemo to i učiniti instalirajte iRASPA Molekularni vizualizator / uređivač putem upravitelja snap paketa. Da bismo to učinili, trebat ćemo samo otvoriti terminal (Ctrl + Alt + T) i izvršiti sljedeću naredbu:
sudo snap install iraspa
Ako u bilo kojem trenutku trebate ažurirajte program, to se može učiniti pokretanjem u terminalu:
sudo snap refresh iraspa
Program možemo pokrenuti iz izbornika Applications / Board / Activities ili bilo kojeg drugog pokretača aplikacija instaliranog na našem računalu. Možemo i mi pokrenite iRASPA Molecular Visualizer / Editor u Ubuntuu pomoću ove naredbe u terminalu (Ctrl + Alt + T):
iraspa
deinstalirati
u deinstalirati iRASPA molekularni preglednik putem Puckanje, morat ćemo samo otvoriti terminal (Ctrl + Alt + T), a zatim izvršiti sljedeću naredbu:
sudo snap remove iraspa
Korisnici će to moći dobiti više informacija o ovom programu od web stranica projekta.