iRASPA Molecular Visualizer / Editor, editor dan visualisator molekul

tentang iRASPA

Pada artikel selanjutnya kita akan melihat iRASPA. Ini adalah editor dan penampil molekuler gratis untuk Gnu / Linux, MacOS dan Windows yang dirilis di bawah lisensi MIT. Mendukung logam, oksida logam, keramik, biomaterial, zeolit, lempung, struktur metalo-organik, dan banyak lagi. Berisi lebih dari 8000 struktur dari database CoRE Metal-Organic Frameworks. Jika Anda bekerja di bidang kimia atau bidang lain yang berhubungan dengan molekul, program ini mungkin berguna untuk Anda. Pada baris berikut kita akan melihat bagaimana kita dapat menginstal penampil molekuler iRASPA di Ubuntu melalui Snap.

Ini adalah paket visualisasi, dengan kemampuan pengeditan, yang ditujukan untuk ilmu material. Lebih jauh lagi, dengan program ini kita akan mampu menangani struktur besar (ratusan ribu atom), termasuk oklusi lingkungan, dengan frame rate yang tinggi. Perangkat lunak ini memanfaatkan teknologi layar terbaru dengan performa yang bagus.

Dengan iRASPA kita dapat membuat dan mengedit struktur, gambar dan film. Itu juga dilengkapi dengan oklusi ambien, rendering rentang dinamis tinggi, permukaan adsorpsi, anotasi teks, replika sel, dan sel super. Mendukung operasi simetri dan silinder, bola, dan poligonal. Format masukan yang didukung adalah; CIF, mmCIF, PDB, XYZ dan VASP POSCAR / CONTCAR / XDATCAR. Format keluaran yang didukung adalah; CIF-, 8/16 bit, RGB / CMYK, TIFF lossless untuk gambar dan mp4 (h264) untuk video.

elemen iRASPA

Program ini telah dibuat oleh David Dubbeldam (University of Amsterdam, Belanda), Sofia Calero (Universitas Pablo de Olavide, Seville, Spanyol) dan Thijs Vlugt (Universitas Teknologi Delft, Belanda). Mereka juga mengandalkan kontribusi Randall Q. Snurr (Universitas Northwestern, Evanston, AS.) dan Chung G. Yongchul (Sekolah Teknik Kimia dan Biomolekuler, Busan, Korea Selatan). Aplikasi tersebut ditulis dalam Swift 4.

Karakteristik umum IRASPA

iRASPA bekerja

Beberapa fitur utama iRASPA adalah:

  • Melalui iCloud, iRASPA memiliki akses ke database CoRE Metal-Organic Frameworks yang berisi 4764 struktur dan 2932 struktur yang ditingkatkan dengan muatan atom.
  • Semua struktur dapat disaring (dalam waktu nyata) menggunakan parameter yang ditentukan pengguna.
  • La jendela utama adalah antarmuka utama Anda untuk melihat, mengedit, dan mengelola semua bagian proyek. Ini menggunakan antarmuka detail master, di mana perubahan pada pengontrol tampilan utama (tampilan master proyek) berubah di tampilan lain.
  • Buat dan edit struktur.
  • Kami bisa menciptakan gambar berkualitas tinggi.
  • Oklusi lingkungan dan rendering rentang dinamis tinggi.
  • Kami akan dapat menciptakan kolase struktur.
  • Program ini akan memungkinkan kita anotasi teks.
  • Replika sel dan sel super.
  • Operasi simetri sebagai grup ruang dan deteksi sel primitif.
  • Perhitungan GPU untuk fraksi kosong dan luas permukaan dalam hitungan detik.

Ini hanyalah beberapa fitur iRASPA. Mereka bisa konsultasikan semuanya secara rinci di Proyek web wiki.

Instal iRASPA di Ubuntu

Untuk menginstal penampil molekuler iRASPA melalui Snap di sistem Ubuntu kami, kami harus memiliki dukungan untuk menginstal teknologi ini. Jika Anda tidak memiliki teknologi ini di sistem Anda, Anda bisa ikuti tutorial yang ditawarkan di snapcraft untuk melanjutkan penginstalan.

Setelah kami dapat menginstal aplikasi snap pada sistem, kami dapat melakukannya instal iRASPA Molecular Visualizer / Editor melalui manajer paket sekejap. Untuk melakukan ini, kita hanya perlu membuka terminal (Ctrl + Alt + T) dan menjalankan perintah berikut:

uninstall iRASPA

sudo snap install iraspa

Jika sewaktu-waktu Anda membutuhkan perbarui program, itu dapat dilakukan dengan menjalankan di terminal:

sudo snap refresh iraspa

Kami dapat memulai program dari menu Aplikasi / Papan / Aktivitas atau peluncur aplikasi lain yang diinstal di komputer kami. Kita juga bisa mulai iRASPA Molecular Visualizer / Editor di Ubuntu menggunakan perintah ini di terminal (Ctrl + Alt + T):

iraspa

Copot pemasangan

untuk uninstall iRASPA molekuler viewer melalui Jepret, kita hanya perlu membuka terminal (Ctrl + Alt + T) dan kemudian menjalankan perintah berikut:

Copot pemasangan iRASPA

sudo snap remove iraspa

Pengguna akan bisa dapatkan lebih banyak informasi tentang program ini dari situs proyek.


tinggalkan Komentar Anda

Alamat email Anda tidak akan dipublikasikan. Bidang yang harus diisi ditandai dengan *

*

*

  1. Penanggung jawab data: Miguel Ángel Gatón
  2. Tujuan data: Mengontrol SPAM, manajemen komentar.
  3. Legitimasi: Persetujuan Anda
  4. Komunikasi data: Data tidak akan dikomunikasikan kepada pihak ketiga kecuali dengan kewajiban hukum.
  5. Penyimpanan data: Basis data dihosting oleh Occentus Networks (UE)
  6. Hak: Anda dapat membatasi, memulihkan, dan menghapus informasi Anda kapan saja.