이 오픈 소스 프로그램으로 Avogadro, 분자 편집 및 시각화

avogadro에 대해

다음 기사에서 우리는 Avogadro를 살펴볼 것입니다. 이것은 Gnu / Linux, Windows 및 MacOS 용 무료 오픈 소스 분자 편집 응용 프로그램. 다음에서 사용할 수있는 프로그램입니다. 전산 화학, 분자 모델링, 생물 정보학, 재료 과학 및 기타 여러 분야.

응용 프로그램은 VTK 분석 및 시각화 기능을 제공합니다. 또한 점 데이터에 대한 볼륨 표현 또는 벡터 필드에 대한 흐름 선을 지원합니다. 유연한 고품질 렌더링과 강력한 플러그인 아키텍처를 제공합니다. 에 관한 것입니다 학생과 연구원이 바로 사용할 수있는 간단하고 사용하기 쉬운 소프트웨어. Avogadro는 Free Software Foundation에서 발행 한 GNU General Public License 조건에 따라 라이선스 버전 2 또는 이후 버전을 재배포 및 / 또는 수정할 수있는 무료 소프트웨어입니다.

다른 웹 기반 2D / 3D 분자 뷰어와 달리 Avogadro는 OpenGL을 직접 사용합니다. 네이티브 데스크톱 패키지를 제공합니다. 이 응용 프로그램은 컴퓨터 프로그램이 2D / 3D 하드웨어 렌더링 기능을 사용할 수 있도록하는 일련의 표준을 사용합니다 (GPU). Avogadro는 즉시 사용 가능한 다중 스레드 계산 및 처리를 지원하고 대화 형 도구, 명령 및 사용자 지정 Python 스크립트를 제공합니다.

Avogadro의 일반적인 특성

황산 분자

  • 다중 플랫폼 프로그램, 그래서 우리는 Gnu / Linux, Windows 및 Mac OSX에서 사용할 수 있습니다.
  • 그것은이다 가벼운 프로그램 고성능을 제공합니다.
  • 제공하는 모든 것에도 불구하고 최소 하드웨어 요구 사항.
  • 프로그램은 다른 언어로 번역, 그대로; 중국어, 프랑스어, 독일어, 이탈리아어, 러시아어, 스페인어 및 기타.
  • 인터페이스가 명확합니다. 사용하기 쉽습니다.
  • 큰 세트를 포함합니다 측정, 정렬, 시각화, 조작 및 그리기 도구.
  • 또한 우리에게 확장 관리자와 함께 번들로 제공되는 확장.
  • 우리를 허용합니다 다양한 응용 프로그램에서 가져 오기.
  • 다양한 개방 형식 지원.

주기율표

  • 우리는 주기율표를 참조하십시오.
  • 우리는 할 수 있습니다 2D 및 3D 분자 모델 구축.
  • 미리 디자인 된 모듈을 삽입, 빌드 및 수정할 수 있습니다. (DNA, RNA, 단편, SMILES, 펩타이드, 폴리머).
  • 정전기 전위 맵 시각화.
  • 사용 분자의 원자 분석 (베이더) : QTAIM 및 WFN.
  • 분자 표면 상호 작용.

분자 형성

  • 우리는 할 수 있습니다 도구 조작, 측정 및 정렬. 우리는 또한 믿을 수 있습니다 선택, 자동 회전 및 자동 최적화 도구.
  • Avogadro는 모든 사용자에게 자습서 개발자는 소스에서 컴파일하고 확장 기능을 제공 할 수 있습니다. 또한 명확한 API 문서를 게시합니다.

Ubuntu에 Avogadro 설치

Avogadro는 사용 가능 flatpak 팩 Ubuntu 시스템 용. 이 프로그램을 설치하기 전에 시스템에서이 기술을 활성화해야합니다. 여전히 가지고 있지 않고 Ubuntu 20.04를 사용하는 경우 계속할 수 있습니다. 가이드 동료가 얼마 전에이 블로그에 글을 썼습니다.

시스템에서이 기술을 이미 활성화 한 경우 설치를 계속할 수 있습니다. 터미널을 열고 (Ctrl + Alt + T) 다음 명령을 실행하여 Avogadro 설치:

avogadro 설치

flatpak install flathub org.openchemistry.Avogadro2

설치 후 다음을 수행 할 수 있습니다. 프로그램 실행 우리 팀의 투수를 찾고 있습니다. 터미널에서 다음 명령을 사용하여 Avogadro 분자 편집기를 열 수도 있습니다.

아보가드로 투수

flatpak run org.openchemistry.Avogadro2

제거

이 프로그램 제거, 터미널을 열고 (Ctrl + Alt + T) 명령을 실행하기 만하면됩니다.

avogadro 제거

flatpak uninstall org.openchemistry.Avogadro2

Avogadro는 계산 화학, 분자 모델링, 생물 정보학, 재료 과학 및 관련 분야와 같은 분야에서 교차 플랫폼 사용을 위해 설계된 고급 분자 뷰어 및 편집기입니다. 또 뭔데 강력한 플러그인 아키텍처로 유연한 품질 렌더링 제공.

이 소프트웨어는 원하는 모든 개발자, 연구원 및 학생이 제한없이 전 세계적으로 사용하는 것을 목표로하는 오픈 소스 프로젝트입니다. 그것은 할 수 있습니다 이 프로그램에 대한 자세한 정보는 프로젝트 웹 사이트 또는 귀하의 GitHub의 페이지.


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