Dalam artikel seterusnya kita akan melihat Avogadro. Ini adalah aplikasi penyuntingan molekul sumber terbuka percuma untuk Gnu / Linux, Windows dan MacOS. Ini adalah program yang boleh digunakan dalam kimia pengkomputeran, pemodelan molekul, bioinformatik, sains bahan, dan banyak bidang lain.
Aplikasi ini digunakan dalam VTK untuk keupayaan analisis dan visualisasi. Ini juga menyokong perwakilan kelantangan untuk data titik atau garis aliran untuk medan vektor. Ia menawarkan rendering berkualiti tinggi yang fleksibel dan seni bina pemalam yang hebat. Ianya mengenai perisian yang ringkas dan senang digunakan, siap digunakan oleh pelajar dan penyelidik. Avogadro adalah perisian percuma yang boleh anda edarkan semula dan / atau ubah suai berdasarkan syarat-syarat Lesen Awam Umum GNU, yang diterbitkan oleh Yayasan Perisian Percuma, sama ada versi 2 dari Lesen atau versi yang lebih baru.
Tidak seperti penonton molekul 2D / 3D berasaskan web yang lain, Avogadro menggunakan OpenGL secara langsung dan menawarkan pakej desktop asli. Aplikasi ini menggunakan satu set standard yang membolehkan program komputer menggunakan fungsi rendering perkakasan 2D / 3D (GPU). Avogadro menyokong pengiraan dan pemprosesan multi-utas di luar kotak, mempunyai alat interaktif, perintah, dan skrip Python tersuai.
Ciri umum Avogadro
- Adakah a program pelbagai platform, jadi kita dapat menggunakannya di Gnu / Linux, Windows dan Mac OSX.
- Ia adalah program ringan menawarkan prestasi tinggi.
- Walaupun semua yang ditawarkannya, ia mempunyai beberapa keperluan perkakasan minimum.
- Programnya ialah diterjemahkan ke dalam bahasa yang berbeza, sepertimana mereka; Cina, Perancis, Jerman, Itali, Rusia, Sepanyol, dan beberapa yang lain.
- Antaramuka jelas dan senang digunakan.
- Termasuk satu set besar alat untuk pengukuran, penjajaran, visualisasi, manipulasi dan lukisan.
- Ia juga akan menawarkan kepada kami sambungan digabungkan dengan pengurus pelanjutan.
- Akan membenarkan kita import dari pelbagai aplikasi.
- Menyokong banyak format terbuka.
- Kami akan dapat rujuk jadual berkala.
- Kita boleh membina model molekul 2D dan 3D.
- Membolehkan anda memasukkan, membina dan mengubahsuai modul yang telah dirancang (DNA, RNA, Fragment, SMILES, Peptide, Polymer).
- Visualisasi peta potensi elektrostatik.
- Penggunaan analisis atom dalam molekul (Lebih teruk): QTAIM dan WFN.
- Interaksi permukaan molekul.
- Kita boleh memanipulasi, mengukur dan menyelaraskan dengan alat. Kita juga boleh bergantung pilihan, putar automatik, dan alat pengoptimuman automatik.
- Pasukan dari Avogadro menawarkan semua pengguna satu set tutorial supaya pembangun dapat membantu, menyusun dari sumber dan menyumbang sambungan anda. Mereka juga menerbitkan dokumentasi API yang jelas.
Pasang Avogadro di Ubuntu
Avogadro adalah tersedia sebagai pek flatpak untuk sistem Ubuntu. Sebelum memasang program ini, kita mesti mengaktifkan teknologi ini dalam sistem kita. Sekiranya anda masih belum memilikinya dan anda menggunakan Ubuntu 20.04, anda boleh teruskan Panduannya bahawa rakan sekerja menulis di blog ini sebentar tadi.
Apabila teknologi ini sudah diaktifkan pada sistem anda, anda boleh meneruskan pemasangan. Anda hanya perlu membuka terminal (Ctrl + Alt + T) dan jalankan perintah berikut ke dalamnya pasang Avogadro:
flatpak install flathub org.openchemistry.Avogadro2
Selepas pemasangan, anda boleh jalankan program mencari kendi dalam pasukan kami. Anda juga boleh membuka editor molekul Avogadro menggunakan arahan berikut di terminal:
flatpak run org.openchemistry.Avogadro2
Nyahpasang
kepada buang program ini, kita hanya perlu membuka terminal (Ctrl + Alt + T) dan melaksanakan perintah di dalamnya:
flatpak uninstall org.openchemistry.Avogadro2
Avogadro adalah penampil dan penyunting molekul canggih, yang dirancang untuk penggunaan lintas platform dalam bidang seperti kimia komputasi, pemodelan molekul, bioinformatik, sains bahan, dan bidang yang berkaitan. Apa lagi menawarkan rendering berkualiti fleksibel dengan seni bina plugin yang hebat.
Perisian ini adalah projek sumber terbuka, yang bertujuan untuk digunakan di seluruh dunia tanpa sekatan oleh semua pembangun, penyelidik dan pelajar yang mahu. Ia boleh dapatkan lebih banyak maklumat mengenai program ini di laman web projek atau dari anda halaman di GitHub.