Avogadro, i-edit at mailarawan ang mga molekula sa bukas na programang mapagkukunan

tungkol sa avogadro

Sa susunod na artikulo ay titingnan natin ang Avogadro. Ito ay isang libre, bukas na mapagkukunan, application ng pag-edit ng molekula para sa Gnu / Linux, Windows at MacOS. Ito ay isang programa na maaaring magamit sa kemikal ng computational, molekular na pagmomodelo, bioinformatics, material science, at maraming iba pang mga larangan.

Ang application ay ginagamit sa VTK para sa mga kakayahan sa pagsusuri at visualization. Sinusuportahan din nito ang representasyon ng lakas ng tunog para sa data ng point o mga linya ng daloy para sa mga patlang ng vector. Nag-aalok ito ng kakayahang umangkop, de-kalidad na pag-render at isang malakas na arkitektura ng plug-in. Ay tungkol sa isang simple at madaling gamiting software, handa nang gamitin ng mga mag-aaral at mananaliksik. Ang Avogadro ay isang libreng software na maaari mong muling ipamahagi at / o baguhin sa ilalim ng mga tuntunin ng GNU General Public Lisensya, na inilathala ng Free Software Foundation, alinman sa bersyon 2 ng Lisensya o anumang susunod na bersyon.

Hindi tulad ng iba pang mga manonood na 2D / 3D na may molekula sa web, Direktang gumagamit ng OpenGL ang Avogadro at nag-aalok ng katutubong mga pakete sa desktop. Gumagamit ang application na ito ng isang hanay ng mga pamantayan na nagpapahintulot sa mga program ng computer na gumamit ng mga pagpapaandar sa pag-render ng hardware 2D / 3D (GPU). Sinusuportahan ng Avogadro ang out-of-the-box na multi-threaded na pagkalkula at pagproseso, may mga interactive na tool, utos, at pasadyang mga script ng Python.

Pangkalahatang katangian ng Avogadro

molekula ng sulpuriko acid

  • Isang programa ng multiplatform, upang magamit natin ito sa Gnu / Linux, Windows at Mac OSX.
  • Ito ay isang magaan na programa nag-aalok ng mataas na pagganap.
  • Sa kabila ng lahat ng inaalok nito, mayroon itong ilan minimum na kinakailangan sa hardware.
  • Ang programa ay isinalin sa iba`t ibang mga wika, tulad nila; Intsik, Pranses, Aleman, Italyano, Ruso, Espanyol, at ilang iba pa.
  • Ang interface nito ay malinaw at madaling gamitin.
  • May kasamang isang malaking hanay ng mga tool para sa pagsukat, pagkakahanay, visualisasyon, pagmamanipula at pagguhit.
  • Inaalok din kami nito ang mga extension ay na-bundle sa manager ng mga extension.
  • Papayagan kami mag-import mula sa iba't ibang mga application.
  • Sinusuportahan ang maraming mga bukas na format.

periodic table

  • Kakayanin namin kumunsulta sa periodic table.
  • Maaari naming bumuo ng mga modelo ng 2D at 3D na molekula.
  • Pinapayagan kang magpasok, bumuo at magbago ng mga predesigned na module (DNA, RNA, Fragment, SMILES, Peptide, Polymer).
  • Pagpapakita ng mga potensyal na mapa ng electrostatic.
  • Paggamit ng pagtatasa ng mga atomo sa mga molekula (Bader): QTAIM at WFN.
  • Mga pakikipag-ugnayan sa ibabaw ng Molecule.

bumubuo ng mga molekula

  • Maaari naming manipulahin, sukatin at ihanay sa mga tool. Maaari din tayong umasa mga tool sa pagpili, auto-rotate, at auto-optimize.
  • Ang koponan ng Nag-aalok ang Avogadro sa lahat ng mga gumagamit ng isang hanay ng tutorials sa gayon ang mga developer ay makakatulong, makaipon mula sa mapagkukunan at mag-ambag ng iyong mga extension. Nag-publish din sila ng malinaw na dokumentasyon ng API.

I-install ang Avogadro sa Ubuntu

Ang Avogadro ay magagamit bilang isang flatpak pack para sa Ubuntu system. Bago i-install ang program na ito, dapat ay mayroon kaming teknolohiyang ito na pinagana sa aming system. Kung wala ka pa rin at ginagamit mo ang Ubuntu 20.04, maaari kang magpatuloy Ang gabay na ang isang kasamahan ay nagsulat sa blog na ito kanina.

Kapag mayroon ka nang nakapagpapagana ng teknolohiyang ito sa iyong system, maaari kang magpatuloy sa pag-install. Kailangan mo lamang buksan ang isang terminal (Ctrl + Alt + T) at patakbuhin ang sumusunod na utos dito i-install ang Avogadro:

i-install ang avogadro

flatpak install flathub org.openchemistry.Avogadro2

Pagkatapos ng pag-install, maaari mo patakbuhin ang programa naghahanap ng pitsel sa aming koponan. Maaari mo ring buksan ang Avogadro molekular editor gamit ang sumusunod na utos sa terminal:

pitsel ng avogadro

flatpak run org.openchemistry.Avogadro2

I-uninstall

Sa alisin ang program na ito, kakailanganin lamang naming buksan ang isang terminal (Ctrl + Alt + T) at isagawa ang utos dito:

i-uninstall ang avogadro

flatpak uninstall org.openchemistry.Avogadro2

Ang Avogadro ay isang advanced na manonood ng molekula at editor, na idinisenyo para sa cross-platform na paggamit sa mga larangan tulad ng computational chemistry, molekular modeling, bioinformatics, material science, at mga kaugnay na lugar. Ano pa nag-aalok ng kakayahang umangkop na rendering ng kalidad na may isang malakas na arkitektura ng plugin.

Ang software na ito ay isang bukas na proyekto ng mapagkukunan, na naglalayong magamit sa buong mundo nang walang mga paghihigpit ng lahat ng mga developer, mananaliksik at mag-aaral na nais. Maaari itong kumuha ng karagdagang impormasyon tungkol sa program na ito sa website ng proyekto o mula sa iyong pahina sa GitHub.


Iwanan ang iyong puna

Ang iyong email address ay hindi nai-publish. Mga kinakailangang patlang ay minarkahan ng *

*

*

  1. Responsable para sa data: Miguel Ángel Gatón
  2. Layunin ng data: Kontrolin ang SPAM, pamamahala ng komento.
  3. Legitimation: Ang iyong pahintulot
  4. Komunikasyon ng data: Ang data ay hindi maiparating sa mga third party maliban sa ligal na obligasyon.
  5. Imbakan ng data: Ang database na naka-host ng Occentus Networks (EU)
  6. Mga Karapatan: Sa anumang oras maaari mong limitahan, mabawi at tanggalin ang iyong impormasyon.