Në artikullin vijues do të hedhim një vështrim në Avogadro. Kjo është një aplikacion redaktimi molekular falas, me burim të hapur, për Gnu / Linux, Windows dhe MacOS. Ky është një program që mund të përdoret në kimi llogaritëse, modelimi molekular, bioinformatika, shkenca e materialeve dhe shumë fusha të tjera.
Aplikimi është përdorur në Vtk për aftësitë e analizës dhe vizualizimit. Ai gjithashtu mbështet përfaqësimin e vëllimit për të dhënat e pikave ose linjat e rrjedhës për fushat vektoriale. Ajo ofron pasqyrim fleksibël, me cilësi të lartë dhe një arkitekturë të fuqishme plug-in. Eshte per një program i thjeshtë dhe i lehtë për t’u përdorur, i gatshëm për t’u përdorur nga studentët dhe studiuesit. Avogadro është softuer i lirë që ju mund ta rishpërndani dhe / ose modifikoni sipas kushteve të Licencës së Përgjithshme Publike GNU, botuar nga Free Software Foundation, qoftë versioni 2 i Licencës ose ndonjë version tjetër.
Ndryshe nga shikuesit e tjerë molekularë 2D / 3D të bazuar në internet, Avogadro përdor OpenGL drejtpërdrejt dhe ofron paketa desktop vendase. Ky aplikacion përdor një sërë standardesh që lejojnë programet kompjuterike të përdorin funksione të pasqyrimit hardware 2D / 3D (GPU) Avogadro mbështet llogaritjen dhe përpunimin me shumë fije jashtë kutisë, ka mjete interaktive, komanda dhe skripta të personalizuar Python.
Karakteristikat e përgjithshme të Avogadro
- Është një program multiplatform, kështu që ne mund ta përdorim atë në Gnu / Linux, Windows dhe Mac OSX.
- Kjo është një program i lehtë duke ofruar performancë të lartë.
- Përkundër gjithë asaj që ofron, ajo ka disa kërkesat minimale të pajisjeve.
- Programi është të përkthyera në gjuhë të ndryshme, siç janë; Kinezisht, Frëngjisht, Gjermanisht, Italisht, Rusisht, Spanjisht dhe disa të tjerë.
- Ndërfaqja e saj është e qartë dhe i lehtë për t’u përdorur.
- Përfshin një grup të madh të mjete për matjen, përafrimin, vizualizimin, manipulimin dhe vizatimin.
- Do të na ofrojë gjithashtu shtesat e bashkuara me menaxherin e shtesave.
- Do të na lejojë import nga aplikacione të ndryshme.
- Mbështet shumë formate të hapura.
- Ne do të jemi në gjendje konsultohuni me tabelën periodike.
- Ne mundemi ndërtojnë modele molekule 2D dhe 3D.
- Ju lejon të futni, ndërtoni dhe modifikoni module të paracaktuara (ADN, ARN, Fragment, BUZIQESH, Peptid, Polimer).
- Vizualizimi i hartave potenciale elektrostatike.
- Përdorimi i analiza e atomeve në molekula (Më keq): QTAIM dhe WFN.
- Ndërveprimet molekulë-sipërfaqe.
- Ne mundemi manipuluar, matur dhe përafruar me mjete. Ne gjithashtu mund të mbështetemi në mjetet e zgjedhjes, rrotullimit automatik dhe optimizimit automatik.
- Ekipi i Avogadro u ofron të gjithë përdoruesve një set të Tutorials kështu që zhvilluesit mund të ndihmojnë, përpilojnë nga burimi dhe kontribuojnë në shtesat tuaja. Ata gjithashtu publikojnë dokumentacionin e qartë të API-së.
Instaloni Avogadro në Ubuntu
Avogadro është në dispozicion si një pako flatpak për sistemin Ubuntu. Para instalimit të këtij programi, duhet ta kemi të mundësuar këtë teknologji në sistemin tonë. Nëse akoma nuk e keni dhe përdorni Ubuntu 20.04, mund të vazhdoni Udhëzuesi që një koleg shkroi në këtë blog pak kohë më parë.
Kur e keni tashmë të aktivizuar këtë teknologji në sistemin tuaj, mund të vazhdoni me instalimin. Thjesht duhet të hapni një terminal (Ctrl + Alt + T) dhe të ekzekutoni komandën e mëposhtme në të instaloni Avogadro:
flatpak install flathub org.openchemistry.Avogadro2
Pas instalimit, mundeni ekzekutoni programin duke kërkuar shtambën në ekipin tonë. Ju gjithashtu mund të hapni redaktuesin molekular Avogadro duke përdorur komandën e mëposhtme në terminal:
flatpak run org.openchemistry.Avogadro2
uninstall
në hiqni këtë program, do të na duhet vetëm të hapim një terminal (Ctrl + Alt + T) dhe të ekzekutojmë komandën në të:
flatpak uninstall org.openchemistry.Avogadro2
Avogadro është një shikues dhe redaktues i avancuar i molekulave, i cili është krijuar për përdorim ndër-platformor në fusha të tilla si kimia llogaritëse, modelimi molekular, bioinformatika, shkenca e materialeve dhe fushat e ngjashme. Cfare ka me shume ofron pasqyrim cilësor fleksibël me një arkitekturë të fuqishme shtojcash.
Ky program është një projekt me burim të hapur, i cili synon të përdoret në të gjithë botën pa kufizime nga të gjithë zhvilluesit, studiuesit dhe studentët që duan. Mundet merrni më shumë informacion në lidhje me këtë program në faqja në internet e projektit ose nga tuajat faqe në GitHub.